北京故宫是现存***建筑中规模最大，保存最完好的***宫殿群，北京故宫虽然参照南京故宫而建，但是规模和层次上要高出很多。南京故宫是明太祖朱元璋建立明朝后，修建的，现存的南京古城墙中华门古城墙是保存最完好的明朝城墙。北京故宫是明成祖朱棣迁都北京后修建的，占地72公顷，分外朝和后宫两大部分，外朝以三大殿:太和殿、中和殿、保和殿为核心，后宫以乾清宫，交泰殿和慈宁宫为核心，规模宏大，大气磅礴，是中华文明史上灿烂的瑰宝。
首先是面积不一样，南京故宫是明朝应天府的皇宫，在建造过程当中经历了20年左右，占地面积超过101.25万平方米，北京故宫是明清两个朝代的皇宫，占地面积72万平方米，相比起来南京故宫占地面积要更大一点。
其次是修建的时间是不一样的，南京故宫是从1966年开始修建，到1392年基本完工，北京故宫是从1406年开始建设，到1420年建成，可以发现南京故宫要比北京故宫要早30多年。
最后是经历的朝代不一样，南京故宫主要是明朝三朝皇宫，北京故宫是明清两个朝代的故宫，在这里住过24位皇帝。
南京博物院 不是 明故宫遗址，位于南京市玄武区中山东路321号，简称南院或南博，其前身是1933年蔡元培等倡建的国立中央博物院，中国第一座由国家投资兴建的大型综合类博物馆。
南京博物院
南京博物院占地13万余平方米，为“一院六馆”格局，即历史馆、特展馆、数字馆、艺术馆、非遗馆、民国馆。另全院设“六所”的研究部门，即考古研究所、文物保护研究所、古代建筑研究所、陈列艺术研究所、非遗保护研究、古代艺术研究所，并设有中国博物馆中唯一的民族民俗学研究机构。1933年，由中国近代民主革命家、教育家，时任国立中央研究院院长的蔡元培先生倡议创建的国主中央博物院筹备处落成。蔡先生亲自兼任第一届理事会理事长，在中山门半山园征地12.9公顷，原拟建“人文”、“工艺”、“自然”三大馆，后因时局关系，仅建“人文馆”，即南京博物院大殿。该建筑为仿辽代宫殿式，由民国著名建筑师徐敬直设计，经建筑***梁思成修改。
南京博物院 当时为中国唯一一座仿照欧美第一流博物馆建馆的现代综合性大型博物馆，直属当时的教育部领导，北平历史博物馆曾归属于中央博物院的建制而成为分院。
明故亮和南博不是同一个地方。
明故宫在南京中山东路两侧，是中世纪最大的宫殿。而南京博物院坐落于紫金山南麓，占地13万余平方米，是中国内地常二大博物馆，中国三大博物馆之一。
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